Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms