Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms