Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms