Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2K7

1700123L14Rik, RIKEN cDNA 1700123L14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123L14RikQ3V2K7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
1700123L14RikQ3V2K7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700123L14RikQ3V2K7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms