Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ckap2Q3V1H1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms