Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms