Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed1Q3V009 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms