Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms