Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca4bQ3UW98 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms