Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms