Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms