Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm648Q3UJ22 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm648Q3UJ22 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms