Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc34Q3UI66 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc34Q3UI66 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms