Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnrc6cQ3UHC0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnrc6cQ3UHC0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnrc6cQ3UHC0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnrc6cQ3UHC0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnrc6cQ3UHC0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnrc6cQ3UHC0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnrc6cQ3UHC0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnrc6cQ3UHC0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnrc6cQ3UHC0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6cQ3UHC0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms