Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp6Q3U6U5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp6Q3U6U5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms