Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
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Hvcn1Q3U2S8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Hvcn1Q3U2S8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Hvcn1Q3U2S8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Hvcn1Q3U2S8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Hvcn1Q3U2S8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Hvcn1Q3U2S8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hvcn1Q3U2S8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hvcn1Q3U2S8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms