Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms