Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms