Protein–RNA interactions for Protein: Q2PFD7

Psd3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd3Q2PFD7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psd3Q2PFD7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psd3Q2PFD7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psd3Q2PFD7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Psd3Q2PFD7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psd3Q2PFD7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psd3Q2PFD7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psd3Q2PFD7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psd3Q2PFD7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psd3Q2PFD7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psd3Q2PFD7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Psd3Q2PFD7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psd3Q2PFD7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psd3Q2PFD7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psd3Q2PFD7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psd3Q2PFD7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psd3Q2PFD7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psd3Q2PFD7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.6 ms