Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrp1aQ2LKU9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp1aQ2LKU9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp1aQ2LKU9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms