Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd300lgQ1ERP8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lgQ1ERP8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms