Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms