Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd12Q0VE29 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Samd12Q0VE29 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms