Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kndc1Q0KK55 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms