Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ebf1Q07802 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms