Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms