Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top1Q04750 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top1Q04750 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top1Q04750 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top1Q04750 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top1Q04750 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top1Q04750 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms