Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms