Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms