Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mmp11Q02853 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms