Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcqQ02111 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms