Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme2Q01768 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms