Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mc1rQ01727 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms