Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HmgcrQ01237 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms