Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stx2Q00262 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx2Q00262 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms