Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pitx2P97474 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx2P97474 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms