Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tp53bp1P70399 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms