Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad50P70388 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad50P70388 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad50P70388 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad50P70388 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad50P70388 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad50P70388 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad50P70388 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad50P70388 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad50P70388 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad50P70388 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad50P70388 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad50P70388 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad50P70388 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad50P70388 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Rad50P70388 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad50P70388 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad50P70388 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad50P70388 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad50P70388 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad50P70388 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad50P70388 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms