Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfixP70257 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfixP70257 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfixP70257 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfixP70257 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfixP70257 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfixP70257 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfixP70257 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfixP70257 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfixP70257 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfixP70257 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NfixP70257 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfixP70257 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfixP70257 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfixP70257 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfixP70257 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfixP70257 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfixP70257 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NfixP70257 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NfixP70257 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfixP70257 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfixP70257 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NfixP70257 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfixP70257 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NfixP70257 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfixP70257 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfixP70257 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfixP70257 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NfixP70257 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfixP70257 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfixP70257 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfixP70257 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfixP70257 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfixP70257 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfixP70257 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfixP70257 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfixP70257 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfixP70257 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfixP70257 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfixP70257 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfixP70257 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfixP70257 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfixP70257 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfixP70257 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfixP70257 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfixP70257 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfixP70257 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfixP70257 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfixP70257 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfixP70257 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NfixP70257 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfixP70257 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfixP70257 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfixP70257 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfixP70257 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfixP70257 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfixP70257 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfixP70257 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfixP70257 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfixP70257 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfixP70257 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NfixP70257 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfixP70257 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfixP70257 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NfixP70257 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfixP70257 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfixP70257 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfixP70257 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfixP70257 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfixP70257 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfixP70257 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfixP70257 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfixP70257 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfixP70257 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfixP70257 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfixP70257 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfixP70257 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfixP70257 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfixP70257 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms