Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chl1P70232 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chl1P70232 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chl1P70232 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chl1P70232 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chl1P70232 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chl1P70232 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chl1P70232 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms