Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Abcc9P70170 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc9P70170 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms