Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkacbP68181 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkacbP68181 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms