Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Barhl1P63157 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms