Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtnP63089 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtnP63089 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtnP63089 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtnP63089 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtnP63089 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtnP63089 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtnP63089 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtnP63089 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtnP63089 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtnP63089 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtnP63089 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtnP63089 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtnP63089 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtnP63089 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtnP63089 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtnP63089 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtnP63089 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtnP63089 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtnP63089 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtnP63089 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtnP63089 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtnP63089 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtnP63089 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtnP63089 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtnP63089 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtnP63089 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtnP63089 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtnP63089 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtnP63089 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtnP63089 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtnP63089 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtnP63089 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtnP63089 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtnP63089 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtnP63089 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtnP63089 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtnP63089 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtnP63089 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtnP63089 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtnP63089 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtnP63089 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtnP63089 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtnP63089 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtnP63089 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtnP63089 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtnP63089 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PtnP63089 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtnP63089 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtnP63089 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtnP63089 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtnP63089 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtnP63089 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtnP63089 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtnP63089 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtnP63089 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtnP63089 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtnP63089 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtnP63089 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtnP63089 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtnP63089 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtnP63089 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtnP63089 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtnP63089 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtnP63089 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtnP63089 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtnP63089 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtnP63089 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtnP63089 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtnP63089 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtnP63089 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtnP63089 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtnP63089 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtnP63089 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtnP63089 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtnP63089 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtnP63089 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtnP63089 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtnP63089 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtnP63089 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtnP63089 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtnP63089 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtnP63089 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms