Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vsnl1P62761 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsnl1P62761 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms