Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rpl18aP62717 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rpl18aP62717 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rpl18aP62717 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rpl18aP62717 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms