Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms