Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms