Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan5P62080 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms