Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps33bP59016 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps33bP59016 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms